公元2108年。

　　时空地球分局实验室，随着一声巨响，正在实验的宇宙飞船瞬间被炸成了碎片，一道裂缝如闪电般在蔚蓝的天空中撕裂。时空被撕开了裂缝形成黑洞，从而打开了时空隧道……由于时空隧道被打开，很多颠覆者通过隧道回到过去，妄图改变历史，统治世界。

　　世界秩序正在被颠覆，时空正在被逆转。大批的时空飞船研究者被屠杀，未来科技已经变成了洗劫历史的帮凶，机器怪物横行，邪恶妖魔重生。人类正在被蚕食、被吞噬，草木为之含悲，风云因之变色……

　　为了维护世界和平，实验主管——艾博士招募志愿者。大批热血沸腾的志愿者投入到与颠覆者战斗的行列中，他们不畏艰险，不怕牺牲，与邪恶势力进行着顽强的殊死抗争……

　　秦破天，颠覆者首领。原联盟实验室主管。由于犯错被解职，一直耿耿于怀。阴谋策划爆炸事故，并释放许多怪物。

　　秦风盈，秦破天之女。志愿者军队首领。奉联盟和艾博士的命令，率领志愿者阻止秦破天。却意外消失……

　　楼越阳，与秦风盈互相倾慕。担任志愿者军队副首领。秦风盈消失后，苦寻未果，向艾博士和联盟请求帮助。

　　你，受到艾博士的派遣，回到过去，帮助楼越阳寻找秦风盈。并和他们一起，阻止秦破天的阴谋。

　　《穿越Online》的故事也由此展开，冒险、战斗、爱情、生活都将逐渐舒展开来……