突然间，墙角的控制台碎片四溅，碎片中主角一跃而起，红色光剑划过Kota的腰部，Kota惨叫着倒地。主角飞奔而来，一剑劈了下去，被Kota用光剑勉强架住。
此时的Kota气喘吁吁，已经没有反击的力量了。两根交叉的光剑不断在Kota的眼前蹦出火花。“年轻人，维达以为他改造了你，但是我能看到你的未来……维达不会一直是你的师傅的，我看到的，是……”
还没等Kota说完，主角便用臂力把Kota招架的光剑压向Kota的脸，Kota的脸部瞬间被灼伤。一声惨叫后，双手捂脸的Kota被主角用原力举了起来，砸向了控制室的玻璃壁。随着玻璃的碎裂，Kota被抛出船坞，飘向了真空。
主角捡起了Kota掉落的光剑：“Juno，任务完成了，我们回去。”
第二关 The Jedi Temple
主角回到了达斯维达的跟前：“师傅，我回来了。”
“Kota大师死了？”维达没有回头，冷冷的问。
“是的。”
“那么我叫你带回来的光剑呢？”
主角低下头，刚准备取光剑，光剑已经自己飞了出去，被维达握在手中。维达透过漆黑的面具，仔细端详着曾经的战友的光剑，突然，他打开了光剑的开关，一道绿光刺向主角的颈部，停在了离主角只有一寸的地方。
“你精神太不集中了！”维达训斥道：“这么容易就被别人取走光剑！刚刚如果是别人取走你自己的光剑，你现在已经死了！现在，去绝地神庙，你的修行还不够，我的弟子。”
“是，师傅。”主角向机库走去。维达没有转头看他，他不禁想起了当年，就是这个孩子夺去自己的光剑。
绝地神庙处于美丽的Coruscant，曾经是绝地修行的地方。不过，自从剿灭绝地叛乱的战火洗礼，神庙已经破败不堪了。
主角的运输机降落在了神庙前面的广场上，守备的克隆人立刻上前阻止：“这个地区已经被皇帝陛下封锁了，任何人不得入内，赶快驾驶你的运输机离开这里。”
随后，守备的克隆人们便倒下了。主角收起了光剑，向神庙内走去。
从前富丽堂皇的神庙内部，如今已是一片废墟，四处都是断壁残垣。主角用原力推开了废墟，向神庙纵深走去。
这是主角第一次来神庙。神庙中央巨大的雕塑，虽然历经沧桑，但依然给人一种庄严肃穆的感觉。主角仿佛听到了神像在诉说： “在这里，你需要使出所有你能想到的所有生存技能。控制恐惧，放下愤怒。”
突然，废墟中出现了一个人影：“1000名绝地武士的死亡，会召唤出噩梦的Darth Desolous。”原来是盘踞在神庙内的西斯武士，很少见地，他不仅有西斯的红色光剑，还有一面巨大的盾牌。
“很快，你也会恐惧地叫着我的名字了，年轻人。”Desolous做出了进攻的姿态。
主角的光剑也发出了嗡嗡声，两名西斯武士扭打在一起。Desolous的特制盾牌，竟然能够完全防御光剑的强大能量，面对对手强大的进攻和没有缝隙的防御，主角陷入了苦战，多次被打倒在地。
究竟该如何取胜？主角陷入了迷茫。控制恐惧，放下愤怒，对，只有这样才能取胜。主角开始冷静对抗着对手的进攻。
“去死吧！”
Desolous急速向主角冲过来，主角并没有做任何防御动作，他全神贯注，将原力提升到了最高，向对手攻了过去！
Desolous急忙举起盾牌防御，但是这股原力的强大远超他的想象，他被推向了背后的神像，重重撞了上去。主角迅速冲上前，抓住Desolous，摔到了地上。此时的Desolous已经摔得眼冒金星。主角跳上神像的肩膀，一下子推到了神像。巨大的神像轰然倒下，Desolous甚至没来得及惨叫，便已被压成肉酱了。
同样已经筋疲力尽的主角，对着神像喘着粗气。这时，机器人Proxy摇摇晃晃走了过来。
“Proxy，你来这里做什么？”
Proxy变成了维达的外形，主角连忙跪下。 “我的情报人员找到了一个绝地，但是我不指望你能活着回来。Kazdan Paratus比你强大的多。但是，如果你打败了他，你将离你的目标更近一步。”
“让我去吧，师傅！”
“是的，我们联手就能打败他。去吧，我的弟子。”
“我不会让你失望的，师傅。”
第三关 Raxus Prime
主角一行人接受命令后，向Raxus飞去。由于这里金属遍地，看起来这是一颗金黄色的星球，进入大气层后，他们见到了一个古老的建筑。“那和绝地神庙还真相似呢。”Juno自言自语道。
由于这颗古老的星球似乎没有现代文明，所以宫殿周围找不到降落的地方，Proxy也收不到有价值的电子信号，只有一些乱七八糟的机器人的呻吟。运输机停在了离宫殿有段距离的空地，主角独自一人下了飞机，向宫殿走去。
废墟中的路还真不好走，到处都是破旧的机器人的残骸。突然间，主角背后的残骸从地上站了起来。到底是怎么回事？不容多想，主角立刻干掉了这些复活的机器人。
途中还有一些体型较大的复活机器人，不过在强大的西斯武士的面前，根本不足为惧。通过坑道后，主角发现当地的土著正和机器人们战斗。一阵乱砍后，土著和机器人纷纷倒下。
主角抓起了一个奄奄一息的土著。“别杀我……求你别杀我……我不想死……Drexl,Drexl! 如果你不杀我，他会……他会帮助你……”随后，他被主角丢向了火药箱。一声巨响，这个可怜的土著灰飞烟灭了。
“我自己去确认吧。”主角朝着那堆灰烬自言自语，随后向深处走去。