索马里本土主要门户是摩加迪沙国际机场(MGQ),航线多经亚的斯亚贝巴、内罗毕、迪拜、伊斯坦布尔等枢纽中转,承运以非洲与中东航司为主,航班时刻与执飞情况常因安全形势调整。索马里兰地区门户为哈尔格萨机场(HGA),经迪拜、亚的斯亚贝巴等地连接,入境规则与索马里本土不同。出发前务必与航空公司核对最新执飞状态。
索马里陆路交通以公路为主,但跨州公路普遍存在武装检查站、路障与袭击风险,非必要不安排陆路长途;即便在相对稳定的索马里兰,也建议白天出行、结伴而行并使用可靠车辆。历史上从埃塞俄比亚或肯尼亚经陆路入境的路线,目前同样不建议采用。
国内城市之间多以小型飞机连接,票务与时刻变化大;柏培拉、博萨索、基斯马尤等港口以货运为主,客船班次稀少。亚丁湾与印度洋海域曾长期受海盗活动影响,国际航运普遍采用护航与警戒措施,私人船只绝不应靠近索马里海域。